利用EST和生物信息学及细胞分子生物学技术研究某基因的功能,试设计技术路线

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查看11 | 回复2 | 2011-1-5 17:17:08 | 显示全部楼层 |阅读模式
首先,EST序列的测序,得到该基因的EST片段其次,生物信息学,用Go或者KEGG,分析该基因的功能分类,所在代谢途径等;通过NCBI Blastn,BlastX,tBlastn等比对与该基因同源性较高的基因序列和可能功能;通过ExPASY研究蛋白的特点,二级结构,三级结构等。之后,根据已得到的信息,依据可能的功能设计细胞分子生物学实验,例如,1利用已知序列,通过RACE方法获得该基因的cDNA全序列,通过巢式PCR或者Tail PCR的方法获得全基因组序列及promotor序列2构建过表达载体,在生物体内过表达该基因,看是否获得可见表性
3构建反义RNA载体,或者RNAi载体,使该基因的表达沉默,看是否获得可见表性
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千问 | 2011-1-5 17:17:08 | 显示全部楼层
先利用EST在网上找出你要研究的那个物种的DNA片段,看看在别的物种中它具有啥功能,根据保守性在你所研究的物种中应该也差不多。把你的基因正义和反义片段分别导入你所研究的物种中,看看对它用啥影响就行啦。你要是没有这个基因的全长那就麻烦了。
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