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如何使用Mfold软件？预测RNA的二级结构？

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1 | 2011-12-8 22:06:28 | 显示全部楼层 |阅读模式

预测RNA二级结构如下进行：1. 选择file|RNA fold single strand启动模块，单击sequence按键，打开对话框以载入序列，此序列必需以.SEQ为扩展文件名，其它序列文件可在序列编辑器中转为此格式。注意必需为大写字母。2. 输入文件名后，缺省值将填充在剩下的区域，这些值可改变。选取 Generate Save File选项，在执行算法后生成存盘文件，此存盘文件用于重新折叠与生成点阵图。3. 在此碱基可被强制为单链或双链或螺旋。4. 单击开始键，开始预测运算。5. 需要的话，选择Draw structure，在绘图模块中看预测的二级结构结果。输出的二级结构以最小自由能顺序排列。但由于方法的...

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