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作者invoker(junkDNA),信区:Bioinformatics
标题听报告时想问的一个问题，还没有机会问出
时间北大未名站(2004年07月03日12:39:41星期六),转信
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对了，对于知识的形式化表述现在都是有些什么方法？除了XML刚刚准备进入这个领域，还一无所知呢，老大们给介绍介绍吧？
chevalier (游侠◎为THU哭泣) 在 ta 的帖子中提到：都讲了些什么？或者ppt？
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作者genepoet(人，生活，计算机),信区:Bioinformatics
标题Re:听报告时想问的一个问题，还没有机会问出
时间北大未名站(2004年07月03日12:58:18星期六),转信
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我没机会听讲座，不知你说的知识形式化是指的什么？难道是人工智能里说的知识的表示方法??
invoker (junkDNA) 在 ta 的帖子中提到：对了，对于知识的形式化表述现在都是有些什么方法？除了XML刚刚准备进入这个领域，还一无所知呢，老大们给介绍介绍吧？
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作者invoker(junkDNA),信区:Bioinformatics
标题Re:听报告时想问的一个问题，还没有机会问出
时间北大未名站(2004年07月03日20:05:39星期六),转信
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恩……和报告没有太多关系了，我听报告喜欢走神的说你的说知识表示方法是什么回事？
genepoet (人，生活，计算机) 在 ta 的帖子中提到：我没机会听讲座，不知你说的知识形式化是指的什么？难道是人工智能里说的知识的表示方法??
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作者biojs(苦命的科学献身者),信区:Bioinformatics
标题Re:听报告时想问的一个问题，还没有机会问出
时间北大未名站(2004年07月03日21:49:09星期六),站内信件
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知识的形式化表述现在都是有些什么方法？
answer：好多啊！有一种roughtheory，（software：rossatte，notthehomologyrossatte），好牛啊！只要有一堆数据，就可推出rules来！比如：有ala，cys能说明什么什么的！然后建好model后，就可prediction，简直是巨无霸！对checkjunkDNA的rules可能有用哦！invoker老兄试试，到时讲讲！
XML？？是跟HTML，cgi的那个xml！那个是搞web的啊
XML是什么？
invoker (junkDNA) 在 ta 的帖子中提到：恩……和报告没有太多关系了，我听报告喜欢走神的说你的说知识表示方法是什么回事？
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作者Feynman(KaKa),信区:Bioinformatics
标题Re:听报告时想问的一个问题，还没有机会问出
时间北大未名站(2004年07月03日21:55:49星期六),转信
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biojs (苦命的科学献身者) 在 ta 的帖子中提到：知识的形式化表述现在都是有些什么方法？answer：好多啊！有一种roughtheory，（software：rossatte，notthehomologyro~~~~~~~~~~~~~~roughsets~~~~~~~~~ssatte），好牛啊！只要有一堆数据，就可推出rules来！比如：有ala，cys能说明什么~~~~~~~~~~~~~hehe,denovorosettaba?什么的！然后建好model后，就可prediction，简直是巨无霸！还真没见过有这么用的,这个软件出来也很久了吧?呵呵
对checkjunkDNA的rules可能有用哦！invoker老兄试试，到时讲讲！XML？？是跟HTML，cgi的那个xml！那个是搞web的啊XML是什么？
googlebioinformaticsandXML
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作者biojs(苦命的科学献身者),信区:Bioinformatics
标题Re:听报告时想问的一个问题，还没有机会问出
时间北大未名站(2004年07月03日22:23:40星期六),站内信件
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feryman太对拉！我出书叫feryman堪错，lylover打广告总没错！
biojs (苦命的科学献身者) 在 ta 的帖子中提到：知识的形式化表述现在都是有些什么方法？answer：好多啊！有一种roughtheory，（software：rossatte，notthehomologyro~~~~~~~~~~~~~~roughsets~~~~~~~~~ssatte），好牛啊！只要有一堆数据，就可推出rules来！比如：有ala，cys能说明什么~~~~~~~~~~~~~hehe,denovorosettaba?answer：youareright！什么的！然后建好model后，就可prediction，简直是巨无霸！
还真没见过有这么用的,这个软件出来也很久了吧?呵呵
answer：getitfromlyloverlastsummer！butican'tfinditfrommycomputer，becauseithasformatNtimes
对checkjunkDNA的rules可能有用哦！invoker老兄试试，到时讲讲！XML？？是跟HTML，cgi的那个xml！那个是搞web的啊XML是什么？
googlebioinformaticsandXML
Feynman (KaKa) 在 ta 的帖子中提到：~~~~~~~~~~~~~~roughsets~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~hehe,denovorosettaba?还真没见过有这么用的,这个软件出来也很久了吧?呵呵googlebioinformaticsandXML
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作者invoker(junkDNA),信区:Bioinformatics
标题Re:听报告时想问的一个问题，还没有机会问出
时间北大未名站(2004年07月04日12:31:19星期天),转信
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是吗？我关心的是数据的表现形式，比如说，PPI用点和边表示，OK,如果加上调控,A调控B,那我们把边加上一个箭头，但是这个调控，可是正也可以是负，ok,我们再在边上加上一个权，到此为止，都可以用图论来描述，再进一步，如果这个调控我们希望研究他的时间，空间信息，怎么办？用一个N元组来作为权么？嘿嘿……，瞎想的。
XML呵呵，就是你说得那个XML,他用来描述知识倒是可以，但是看上去走不太远啊，而且最后似乎也还是要归结到关键字搜索一类的咚咚:)
你说得那个理论我不懂，能推荐点好文献么？惭愧惭愧
biojs (苦命的科学献身者) 在 ta 的帖子中提到：知识的形式化表述现在都是有些什么方法？answer：好多啊！有一种roughtheory，（software：rossatte，notthehomologyrossatte），好牛啊！只要有一堆数据，就可推出rules来！比如：有ala，cys能说明什么什么的！然后建好model后，就可prediction，简直是巨无霸！对checkjunkDNA的rules可能有用哦！invoker老兄试试，到时讲讲！XML？？是跟HTML，cgi的那个xml！那个是搞web的啊XML是什么？
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作者invoker(junkDNA),信区:Bioinformatics
标题Re:听报告时想问的一个问题，还没有机会问出
时间北大未名站(2004年07月04日12:32:20星期天),转信
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呵呵，你的qmd越来越国际化了，:)
Feynman (KaKa) 在 ta 的帖子中提到：~~~~~~~~~~~~~~roughsets~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~hehe,denovorosettaba?还真没见过有这么用的,这个软件出来也很久了吧?呵呵googlebioinformaticsandXML
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作者chevalier(游侠◎为THU哭泣),信区:Bioinformatics
标题Re:听报告时想问的一个问题，还没有机会问出
时间北大未名站(2004年07月04日14:57:58星期天),转信
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..........AI要能到这一步大家都不用干活了roughtheory哪有你说的这么神biojs (苦命的科学献身者) 在 ta 的帖子中提到：知识的形式化表述现在都是有些什么方法？answer：好多啊！有一种roughtheory，（software：rossatte，notthehomologyrossatte），好牛啊！只要有一堆数据，就可推出rules来！比如：有ala，cys能说明什么什么的！然后建好model后，就可prediction，简直是巨无霸！对checkjunkDNA的rules可能有用哦！invoker老兄试试，到时讲讲！XML？？是跟HTML，cgi的那个xml！那个是搞web的啊XML是什么？
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作者cdragon(eaGle),信区:Bioinformatics
标题Re:听报告时想问的一个问题，还没有机会问出
时间北大未名站(2004年07月04日15:02:08星期天),转信
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invoker (junkDNA) 在 ta 的帖子中提到：是吗？我关心的是数据的表现形式，比如说，PPI用点和边表示，OK,如果加上调控,A调控B,那我们把边加上一个箭头，但是这个调控，可是正也可以是负，ok,我们再在边上加上一个权，到此为止，都可以用图论来描述，再进一步，如果这个调控我们希望研究他的时间，空间信息，怎么办？用一个N元组来作为权么？嘿嘿……，瞎想的。
这时可以把edge看作一个object或者转换一下？边=点转换
XML呵呵，就是你说得那个XML,他用来描述知识倒是可以，但是看上去走不太远啊，而且最后似乎也还是要归结到关键字搜索一类的咚咚:)你说得那个理论我不懂，能推荐点好文献么？惭愧惭愧
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作者Feynman(KaKa),信区:Bioinformatics
标题Re:听报告时想问的一个问题，还没有机会问出
时间北大未名站(2004年07月04日15:51:51星期天),转信
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呵呵，roughsets要是这么神，SVM岂不是能成佛了，厉害！
chevalier (游侠◎为THU哭泣) 在 ta 的帖子中提到：..........AI要能到这一步大家都不用干活了roughtheory哪有你说的这么神
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作者invoker(junkDNA),信区:Bioinformatics
标题Re:听报告时想问的一个问题，还没有机会问出
时间北大未名站(2004年07月04日16:34:07星期天),转信
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看作是object没有问题，问题是这个信息如何表示？比如空间信息，假设在细胞器A，tissuesT1,T2,...,我们用A的名称关键字作为该对象的loc属性值，T1,T2,...作为tissue属性的值，但是这里还是没有说清楚T1，T2和A的关系，……，说清楚大约用XML或者LISP是不成问题的，我只是感到这样的方式在数学上显得非常的……非形式化（?）
另外，您说得边点转换是什么目的阿？不太明白的说，我只知道有时候这样的仿射变换可以形式更加好看，对这个问题有帮助么？谢谢。
cdragon (eaGle) 在 ta 的帖子中提到：这时可以把edge看作一个object或者转换一下？边=点转换
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作者Feynman(KaKa),信区:Bioinformatics
标题Re:听报告时想问的一个问题，还没有机会问出
时间北大未名站(2004年07月04日17:08:11星期天),转信
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invoker (junkDNA) 在 ta 的帖子中提到：是吗？我关心的是数据的表现形式，比如说，PPI用点和边表示，OK,如果加上调控,A调控B,那我们把边加上一个箭头，但是这个调控，可是正也可以是负，ok,我们再在边上加上一个权，到此为止，都可以用图论来描述，再进一步，如果这个调控我们希望研究他的时间，空间信息，怎么办？用一个N元组来作为权么？嘿嘿……，瞎想的。
空间信息是不是可以先划分成不同的module，根据不同的module来描述，时间信息可以用edge的长度来表示，edge的粗细可以表述调控的性质或者confidence，gene也未必用点来表示，现在不少模型是用圈来描述，这就可以加入不少变量了，比如圈的形状和颜色，总是图论模型还有不少变化的，不过目前因为很多其他因素的限制，只能在单细胞模型中使用。。。
你瞎想，我瞎说，嘿嘿
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作者cdragon(eaGle),信区:Bioinformatics
标题Re:听报告时想问的一个问题，还没有机会问出
时间北大未名站(2004年07月04日17:29:19星期天),转信
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invoker (junkDNA) 在 ta 的帖子中提到：看作是object没有问题，问题是这个信息如何表示？比如空间信息，假设在细胞器A，tissuesT1,T2,...,我们用A的名称关键字作为该对象的loc属性值，T1,T2,...作为tissue属性的值，但是这里还是没有说清楚T1，T2和A的关系，……，说清楚大约用XML或者LISP是不成问题的，我只是感到这样的方式在数学上显得非常的……非形式化（?）
XML是树状结构，LISP好像也是（递归表解结构）
呵呵，完全可以用object来表示的搜索的时候，还可以对不同的项做索引，就可以在功能完善的情况下，还保证了速度（不过需要增加一些空间需求）
呵呵，有问题，我们不妨多讨论
另外，您说得边点转换是什么目的阿？不太明白的说，我只知道有时候这样的仿射变换可以形式更加好看，对这个问题有帮助么？谢谢。
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作者invoker(junkDNA),信区:Bioinformatics
标题Re:听报告时想问的一个问题，还没有机会问出
时间北大未名站(2004年07月04日17:59:20星期天),转信
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恩，嘿嘿，这样做visualization倒是很work的，不知道用来分析“照不照”:)
Feynman (KaKa) 在 ta 的帖子中提到：空间信息是不是可以先划分成不同的module，根据不同的module来描述，时间信息可以用edge的长度来表示，edge的粗细可以表述调控的性质或者confidence，gene也未必用点来表示，现在不少模型是用圈来描述，这就可以加入不少变量了，比如圈的形状和颜色，总是图论模型还有不少变化的，不过目前因为很多其他因素的限制，只能在单细胞模型中使用。。。你瞎想，我瞎说，嘿嘿
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作者chevalier(游侠◎为THU哭泣),信区:Bioinformatics
标题Re:听报告时想问的一个问题，还没有机会问出
时间北大未名站(2004年07月04日19:06:35星期天),转信
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这只是表示模型不是分析模型invoker (junkDNA) 在 ta 的帖子中提到：恩，嘿嘿，这样做visualization倒是很work的，不知道用来分析“照不照”:)
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作者invoker(junkDNA),信区:Bioinformatics
标题Re:听报告时想问的一个问题，还没有机会问出
时间北大未名站(2004年07月04日19:09:17星期天),转信
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是呀,那么分析模型是……
chevalier (游侠◎为THU哭泣) 在 ta 的帖子中提到：这只是表示模型不是分析模型
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作者aroluna(摇曳生姿，亭亭玉立),信区:Bioinformatics
标题Re:听报告时想问的一个问题，还没有机会问出
时间北大未名站(2004年07月04日20:52:41星期天),转信
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yourqmdissoooooooooooogoodireallylikeit@_@
invoker (junkDNA) 在 ta 的帖子中提到：是呀,那么分析模型是…… |
