生物信息版范文[1](转载)

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0 | 2021-1-30 01:58:55 | 显示全部楼层 |阅读模式

【以下文字转载自New_Board讨论区】【原文由BRen所发表】
DNA序列数据库
EMBLEMBL是欧洲生物信息学研究所(EuropeanBioinformaticsInstitute,EBI)创建的一个核酸序列数据库。EMBL的数据来源主要有两部分，一部分由科研人员或某些基因组测序机构通过计算机网络直接提交，另一部分则来自科技文献或专利DDBJDDBJ是DNADataBankofJapan的简称，始建于1986年，由国立遗传学研究院负责数据库的建设，维护及数据的传播，并与EMBL和GenBank合作；GenBankGenBank是美国国家生物技术信息中心(NationalCenterforBiotechnologyInformation，NCBI)建立的DNA序列数据库。为保证数据尽可能的完全，GenBank与EMBL、DDBJ建立了相互交换数据的合作关系。
GeneBank数据库序列实例GenBank的17个子数据库名称和含义代码英文含义中文含义PRIPrimate灵长类动物RODRodent啮齿类动物MAMOthermammalian其它哺乳动物VRTOthervertebrate其它脊椎动物INVInvertebrate无脊椎动物PLNPlant,fungal,algal植物、真菌、藻类BCTBacterial细菌RNAStructuralRNA结构RNAVRLViral病毒PHGBacteriophage细菌噬菌体SYNSynthetic合成产物UNAUnannotated未注明来源ESTExpressedSequenceTags表达序列标记PATPatent专利STSSequenceTaggedSites序列标记位点GSSGenomeSurveySequences基因组勘察序列HTGHighThroughputGenomicSequences高通量基因组序列
dbESTEST数据存储在dbEST数据库内。序列信息以及dbEST的注释摘要，也按DNA的分类分成了若干子数据库。
特定基因组资源这种独特数据资源存在的意义在于强调(a)特定物种的基因组，(b)特殊的测序技术。SGD酵母基因组数据库SGD包括了啤酒酵母的分子生物学及遗传学信息。酵母基因组的重要性在于，1998年它成为第一个完整测序的真核生物基因组。SGD展示酵母的各种物理、遗传、和序列特性图谱。UniGeneUniGene通过从GeneBank中调出一些不包括多余部分、面向基因的序列串组成一个转录图谱。TDBTIGR数据库(TDB)包括DNA及蛋白质序列，基因表达，细胞功能以及蛋白质家族信息，并且还收录有人、植物、微生物等的分类信息，是一套大型综合数据库。ACeDBAceDB数据库，是线虫（C.Elegans）基因组计划的一个成果。

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