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在运行CRISP软件时出错

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查看11 | 回复0 | 2021-2-27 01:19:46 | 显示全部楼层 |阅读模式
在运行CRISP进行callingvariant时出现错误
lzw@LAPTOP-474SHEFV:/mnt/e/BS/SH11$/mnt/e/BS/CRISP-122713/CRISP--bams/mnt/e/BS/SH11/SH11_dup.bam--ref/mnt/e/毕设数据/SH11/GCF_000002495.2_MG8_genomic.fna--mmq40--minc10--VCFSH11_variant.vcf
CRISPoptions:QVoffset33min_base_quality13min_mapping_score40max_permutations20000poolsize2CT-pvalue-thresh-3.5QV-pvalue-thresh-5.0
readingfastaindexfile/mnt/e/BS/SH11/GCF_000002495.2_MG8_genomic.fna.fai...fastafile/mnt/e/BS/SH11/GCF_000002495.2_MG8_genomic.fnahas53chromosomes/contigs
processing5610956bamfiles:.....
poolsizeforeachsampleis2
open:Nosuchfileordirectory
unabletoopentheBAMfile
提示我找不到文件路径，无法打开bam文件，但我得文件目录下存在bam文件

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